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Todo disco duro se divide en sectores lógicos donde se guarda la información, esto sucede en todo sistema operativo y es inevitable. Para darte un ejemplo práctico, piensa en una biblioteca donde hay muchas estanterías con muchos estantes cada una, donde se almacenan colecciones de enciclopedias. Esta biblioteca sería tu disco duro.

Cada enciclopedia cuenta con varios tomos y representaría a un fichero en el disco duro. La primera vez que cargas la información se hace en forma secuencial, pero cuando alguien se lleva una colección de enciclopedias y trae otra con más cantidad de tomos, la colección se "fragmenta" en dos partes. Luego de quitar y agregar distintas enciclopedias de distintos tamaños, las enciclopedias se desparraman de tal manera que serían pocos los tomos consecutivos en cada estante. Así es como se fragmenta la información.

Por fortuna, el encargado de la biblioteca lleva un índice colgado del hombro y lo actualiza cada vez que agrega o quita un tomo. Este índice es complejo y es una tarea árdua actualizarlo constantemente, pero le permite en cualquier momento encontrar y rápidamente todos los tomos de una enciclopedia en forma ordenada. Este encargado y su índice son el Sistema de Archivos o "File System".

Multiplica este ejemplo millones de veces, con enciclopedias que varian entre uno y miles de tomos, y ponlo en un escenario donde se realizan remueven y agregan miles de enciclopedias todos los días. El disco duro funciona siempre de la misma manera y la fragmentación de archivos es inevitable, independientemente del sistema operativo.

Una de las grandes diferencias entre sistemas operativos, que hace una gran diferencia en cuanto a velocidad y confiabilidad, es el sistema de archivos.

Los sistemas FAT y NTFS se ven muy afectados por la fragmentación de archivos. Con el paso del tiempo el rendimiento del ordenador degrada considerablemente y es necesario defragmentar el disco periódicamente, dependiendo del las condiciones de uso.

Debido a que la fragmentación es una condición natural e inevitable. El echo de que un sistema de archivos se vea afectado de tal manera por la fragmentación de archivos, me parece simplemente inaceptable.

El sistema de archivos ext2 (Second Extended File System) fue lanzado en el año 1993 y ya en aquel entonces soportaba nombres de archivos de hasta 255 caracteres, atributos y permisos, y eliminaba el problema de la defragmentación.

FAT32 y NTFS no sólo todavía sufren la fragmentación sino que no son tan eficaces como ext2, y ni mencionar a ext3 con el agregado del "journaling" que garantiza recuperación instantánea en caso de perdidas de energía. ext3 ya está incorporado a casi todas las distribuciones e linux.

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